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先把争论放一边
有很多关于演化论是不是好的争论。比如，希特勒喜欢演化论，并用演化论来合理化自己的日耳曼人至上主义，并对其他人中大肆征伐屠杀。一些理论家也拿它来为自己的阶级理论进行辩护，比如最近还有鼓励富人高学历人多生孩子，穷人少生孩子的建议。这些就是臭名昭著的“社会达尔文主义”。曾经，演化论与宗教创世论以及“智能设计”论等派的争论喧嚣尘上，至今未休。
作者建议，先把这些争论放一边，先了解了各方观点和证据再来判断不迟。而且，一个理论如果被拿来做坏事，你很难说是理论的责任。就像菜刀能用来在厨房切菜，也有人拿它去看人。把杀人的罪过归于菜刀，似乎就说不过去了。
自然选择的配方
自然选择的配方有三个关键因素，一曰多样性，一曰结果，一曰遗传。三者缺一，自然选择都不能完成。
多样性是指生物会发展出多种特性特点，比如，身高体重颜值肤色……等等一切可以被主管或者客观测量的特性都有着许多差别。结果是指这些特性特点在生物所处的环境中是否能帮助其增加或减少生存和繁衍的机会。增加机会的特点，被称为适应性。遗传是指父母的适应性特性可以通过遗传传递给后代。
另一种思考方式
在对事物进行的的时候，演化论提供了宗教和物质解释（materialism）之外的另一种思考和解释问题的思路。在演化论出现之前，人们对事物的特质和功能大概有两种解释：神创造的或者这是该事物本身的性质决定的。演化论和自然选择则提供事物的形态和功能可能是它们对环境适应的结果。
这种思路不止于思想家的清谈，而是任何人都可以可以“卷起袖子去干”，去验证的。作者认为，科学与种菜，盖房子等职业没有什么不同，必须“卷起袖子”去干，才是做科学的正确方法。我不知道这是不是唯一正确的方法，但是觉得这把自己的命运和问题交给神，似乎是懒惰的做法。
证实你的理论
宗教似乎无需证明自己。但是宗教人士还是乐于在生活中寻找奇迹，寻找人类暂时无法解释的事件来作为神存在的证明。我的一个信教的朋友曾经转发过这样一件事，一个女孩开车遇到车祸，被卡在车中。警察，消防员和热心群众忙活了半天，也弄不出来。就在女孩快要放弃希望的时候，凭空出现了一个神父，来到女孩身边，对她说，“你不会有事的，我们一起来祈祷”。没过多长时间，消防人员突然就把车给分离开了，女孩得救。就当人们把女孩送到医院后，才发现神父不见了。这个神秘出现又神秘消失的神父成了一个谜，因为所有在场的人都说，从来没见过这个神父，也没人注意到他何时出现合适消失的。一时间所有的人都传说，他们见证了奇迹，那个神父一定是上帝的化身。当然，得救的女孩与其家人，在电视媒体的面前，一个劲儿的感谢上帝，哈利路亚。而真正拯救她于危难的消防员，似乎并没有被提及。
要说奇迹，达尔文发现演化论到可以是算是一个。他在著作中写道，这个能解决他诸多疑问的理论在他脑海中显现的那一刻，他清楚的记得当时的所有状况：“事发的地点，马车的铃声，和当时的极乐……”
证明
演化论的推导，来自于对自然中众多事件的观察。由于这个理论代替了上帝来解释各种事情，所以被各种宗教相关的人士所不容，从而受到攻歼甚至诽谤。然而最狠的说法就是“演化论无法被证明”。
演化论者不这么认为。一个理论体系是否正确，或者其用处是用来产生假说和预测。宗教在这方面明显不足。
如何证明演化论是正确的呢？科学家们是这么干的，根据理论对问题提出可能的解释和预测，然后通过观察和实验去验证。如果观察到的数据和结果能够验证基于理论的预测，那么科学实验得到的事实就应该被当作支持该理论的证据。证据越多，理论越可信。
演化结果不总是好的
某个种群当下的适应，很可能在长期损害整体。比如自私的秉性在短期看来，对个体或者一个组织是有好处的，但是通过自己的利益不惜损害他人或者总体的利益，在长远来看会损害整体，造成种群消亡。那么个体的自私获得的短期利益在长期会收到惩罚。
这是因为判断一个对某一个特性的选择是不是好，要从群体利益上看而不是看个体得失。书中有一个例子非常好的说明了这个问题。这里描述一下：
假设你是个养鸡场老板，想自己繁殖一些下蛋多的鸡。有两种方法：一，取9组鸡，每组9只。纪录每只鸡的产蛋量一个月，每组中取产蛋量最高的一只，繁殖他们的后代。从他们后代中再取81只鸡，分成九组，重复上述过程。二，也是9组鸡，每组9只，纪录每组共同产蛋量，取产蛋量最大的一组，繁殖他们的后代，其中再取81只，分九组，重复该过程。我们的假设是，几代之后，我们应该得到产蛋量比较高的种群。那么老板，题来了你选哪种方法呢？
答案在下一篇笔记中揭晓。
2015-07-27 初稿
2015-07-28 补充最后三部分